Descubren las etapas iniciales del mecanismo de plegamiento de las proteínas de membrana, claves en el diseño de fármacos
Un equipo internacional coordinado por la Estructrura de Investigación Interdisciplinar en BiotecnologÃa y Biomedicina (ERI BioTecMed) de la Universitat de València ha demostrado cómo se inicia el plegamiento de las proteÃnas de membrana antes de insertarse en las membranas biológicas, hecho que ha sido centro de la investigación bioquÃmica durante décadas. El estudio, publicado en la revista Nature Communications, ha sido coordinado por Ismael Mingarro, catedrático de BioquÃmica y BiologÃa Molecular de la institución académica.
La relevancia de esta investigación reside en que, como las proteÃnas de membrana son las receptoras de más de la mitad de los fármacos actualmente en el mercado, es de vital importancia conocer su plegamiento para diseñar medicamentos más eficientes. "Que el artÃculo publicado, «Transmembrane but not soluble helices fold inside the ribosome tunnel», explique que el plegamiento empiece antes de que la proteÃna se haya acabado de sintetizar es un gran descubrimiento para comprender cómo adoptan su estructura funcional estas importantes dianas farmacológicas", ha explicado Ismael Mingarro.
Las proteÃnas, formadas por aminoácidos unidos por enlaces peptÃdicos, son las macromoléculas biológicas que llevan a cabo la mayorÃa de las funciones biológicas de los seres vivos. La máquina celular que se encarga de sintetizar esos enlaces son los ribosomas, los cuales los incorporan según la orden codificada por el RNA (ácido ribonucleico) mensajero. Esta cadena de aminoácidos tiene que adoptar la estructura funcional de la proteÃna. El objetivo de la investigación ha sido estudiar el mecanismo de plegamiento de las proteÃnas para saber cómo y cuándo se da el plegamiento adecuado.
La principal novedad que aporta la investigación es que el ribosoma actúa como una plataforma para la selección de secuencias que tienen que adoptar una estructura local (helicoidal) en estados muy iniciales de la biosÃntesis de proteÃnas. Este hecho implica que el ribosoma sea considerado como la primera chaperona molecular (que ayuda al plegamiento de proteÃnas) para posibilitar el plegamiento de aquellas secuencias que tienen que adoptar una estructura helicoidal para aumentar la eficiencia de su subsiguiente integración en la membrana.
"En este trabajo hemos demostrado que la estructura helicoidal se logra en el interior del ribosoma, a diferencia de lo que ocurre en el caso de regiones helicoidales de proteÃnas solubles, y que depende de la helicidad y de la apolaridad de los aminoácidos asà como de la longitud de la región hidrofóbica", explica Ismael Mingarro, coordinador del equipo que ha llevado a cabo la investigación. De este modo, el estudio muestra que el ribosoma reconoce las regiones transmembrana y facilita el entorno adecuado para su plegamiento.
Experimentos en Valencia
La investigación se ha desarrollado, principalmente, en la ERI de BiotecnologÃa y Biomedicina (Departamento de BioquÃmica y BiologÃa Molecular) de la Universitat de València, donde se han llevado a cabo todos los experimentos de traducción de proteÃnas in vitro, y también a la School of Chemistry and Biochemistry del Georgia Institute of Technology (Estados Unidos), donde se han realizado las simulaciones computacionales.
Además, en el estudio también han participado investigadores del Departamento de BioquÃmica y BiofÃsica de la Universidad de Estocolmo y del Departamento de BiologÃa y BioquÃmica de la Universidad de Bath (Reino Unido).
La investigación ha contado con la financiación del Ministerio de EconomÃa y Competitividad (fondos FEDER), del programa PROMETEO de la Generalitat Valenciana y de la US National Science Foudation, entre otros.