El CIPF apuesta por la última tecnología en análisis de genes para diseñar fármacos más eficaces
La revista científica Nucleic Acids Research destaca en un artículo especial la eficiencia de la herramienta bioinformática “Babelomics”
La aplicación bioinformática Babelomics ha acumulado alrededor de 2000 citas en artículos científicos
La genómica funcional abre las puertas al diagnóstico y al potencial tratamiento de distintas enfermedades
Babelomics es un paquete completo de herramientas bioinformáticas avanzadas, capaz de estudiar la actividad de todos los genes del genoma medidos con la técnica de microarrays o con secuenciación de nueva generación; y de deducir las implicaciones funcionales del experimento. Como apunta Joaquín Dopazo, investigador principal del Departamento de Bioinformática y Genómica del CIPF, “Babelomics es una aplicación muy completa, que analiza si hay actividad en los genes, hace experimentos de genotipado, examina si hay mutaciones, y además genera una interpretación de la función de los genes”.
La investigación sobre genes en biomedicina da lugar a un enorme volumen de datos con el que sólo se puede operar por medio de herramientas bioinformáticas capacitadas para procesar y analizar una gran cantidad de información. El conocimiento científico generado abre las puertas a nuevos paradigmas y métodos para avanzar en el estudio de enfermedades, su diagnóstico y su potencial tratamiento.
Indicadores de impacto
Las estadísticas de uso de Babelomics confirman que el programa se utiliza en más de 1000 experimentos diarios de laboratorios y centros de investigación de todo el mundo. Según el artículo en la revista NAR, la herramienta ha contado con más de 65.000 usuarios anónimos, y 4.521 usuarios registrados que han empleado la herramienta desde su lanzamiento.
El mapa de uso de la herramienta presenta una proyección internacional que se expande por todo el mundo. El investigador Joaquín Dopazo apunta que “Europa, sureste asiático y EEUU están conectados casi permanentemente, aunque también hay usos importantes en Australia y en el resto del mundo”.
Otro de los factores que indican la utilidad de la herramienta es la cifra de alrededor de 2000 citas recogidas en trabajos científicos, un número elevado que alude a la cantidad de veces que investigadores de otros centros han usado está aplicación para el análisis de datos de sus investigaciones.
En opinión de Dopazo, el programa Babelomics “es una respuesta a la creciente necesidad de integrar y analizar diferentes tipos de datos genómicos con la ayuda de una aplicación que incluye un surtido de métodos de análisis de expresión de genes, y permite una sencilla interpretación funcional de los resultados”.
Estudios orientados a futuros tratamientos
Una de las aplicaciones de la genómica funcional se dirige a la caracterización de las bases genéticas y los mecanismos moleculares de las enfermedades, para identificar así dianas terapéuticas frente a las cuales desarrollar nuevos fármacos. El objetivo es la identificación de genes similares implicados en esas enfermedades frente a los que se pueda actuar. Para ello, la técnica de los microarrays sirve para examinar la actividad de todos los genes, y comprobar si están funcionando. Por otra parte, el genotipado busca marcadores de enfermedad y de diagnóstico, con el fin de localizar los genes potencialmente dañados.
La investigación en genómica permite de esta forma mejorar nuestros sistemas de clasificación de enfermedades. Por ejemplo diagnósticos complejos de determinadas patologías podrían ser reemplazados por definiciones concretas, cada una de ellas bien caracterizada a nivel genético y molecular. “El objetivo principal es conseguir diagnósticos más precisos, mejores indicadores para la evaluación de fármacos y tratamientos farmacológicos más específicos, todo ello con la aplicación de procedimientos basados en altas tecnologías”, apunta el investigador Joaquín Dopazo.
Unas potentes herramientas bioinformáticas
El departamento de Bioinformática y Genómica del CIPF realiza una investigación puntera en bioinformática orientada al descubrimiento de nuevos fármacos desde una aproximación a la biología de sistemas. El equipo de investigación trabaja en distintos proyectos biomédicos con una perspectiva multidisciplinar que respalda la solidez de los resultados.
Este departamento ha diseñado ocho potentes aplicaciones bioinformáticas capacitadas para analizar datos de distintas técnicas de alto rendimiento. Todas estas herramientas son de uso abierto y gratuito a través de su página web, y se utilizan diariamente para analizar experimentos en centros de investigación de todo el mundo.
